35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2457 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2457  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  289  7e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0270573  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0455  hypothetical protein  50 
 
 
144 aa  142  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596707  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3965  hypothetical protein  50 
 
 
138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0275074  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2844  hypothetical protein  45.45 
 
 
144 aa  130  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00819039  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1730  hypothetical protein  49.04 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000217513  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3105  hypothetical protein  37.23 
 
 
152 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.965221  normal  0.584323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2101  hypothetical protein  39.02 
 
 
141 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0911395  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3578  hypothetical protein  34.51 
 
 
162 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461789  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3349  hypothetical protein  34.51 
 
 
142 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.42671  normal  0.0171262 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4536  hypothetical protein  28.1 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251544  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0458  hypothetical protein  30.39 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0733  hypothetical protein  29.41 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0105  hypothetical protein  29.41 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516432  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1483  hypothetical protein  29.41 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0550  hypothetical protein  29.41 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906026  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0566  hypothetical protein  29.41 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2912  hypothetical protein  29.41 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0303  hypothetical protein  28.43 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0488  hypothetical protein  31.37 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0572  hypothetical protein  27.1 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541327  hitchhiker  0.00799235 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2873  hypothetical protein  30.39 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6143  hypothetical protein  32.35 
 
 
127 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2731  hypothetical protein  30.39 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3581  hypothetical protein  26.89 
 
 
160 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1519  hypothetical protein  23.36 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2199  hypothetical protein  30.38 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.699425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2813  hypothetical protein  30.38 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2824  hypothetical protein  30.38 
 
 
127 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5108  hypothetical protein  23.21 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4144  hypothetical protein  28.57 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1070  hypothetical protein  25.71 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00610238  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3016  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.689478  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1556  hypothetical protein  29.46 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1295  hypothetical protein  26.24 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.211748  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1510  hypothetical protein  24.18 
 
 
191 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.596874  hitchhiker  0.0000103591 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>