34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3105 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3105  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  300  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.965221  normal  0.584323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2101  hypothetical protein  38.06 
 
 
141 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0911395  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0455  hypothetical protein  41.48 
 
 
144 aa  108  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596707  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3578  hypothetical protein  39.71 
 
 
162 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461789  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2457  hypothetical protein  37.41 
 
 
143 aa  106  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0270573  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3349  hypothetical protein  38.06 
 
 
142 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.42671  normal  0.0171262 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3965  hypothetical protein  34.81 
 
 
138 aa  100  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0275074  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1730  hypothetical protein  45.36 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000217513  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2844  hypothetical protein  39.52 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00819039  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0733  hypothetical protein  33.94 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0105  hypothetical protein  33.94 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516432  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1483  hypothetical protein  33.94 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0550  hypothetical protein  33.94 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906026  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0566  hypothetical protein  33.94 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2912  hypothetical protein  33.94 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0458  hypothetical protein  33.03 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0572  hypothetical protein  31.48 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541327  hitchhiker  0.00799235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0488  hypothetical protein  32.41 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4536  hypothetical protein  28.7 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251544  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6143  hypothetical protein  32.08 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0303  hypothetical protein  30.56 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2824  hypothetical protein  32.08 
 
 
127 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2813  hypothetical protein  32.08 
 
 
127 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2199  hypothetical protein  32.08 
 
 
127 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.699425  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3581  hypothetical protein  29.86 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1556  hypothetical protein  31.9 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2731  hypothetical protein  30.19 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2873  hypothetical protein  30.19 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1070  hypothetical protein  33.64 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00610238  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5108  hypothetical protein  31.25 
 
 
129 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4144  hypothetical protein  27.52 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1519  hypothetical protein  25.93 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3016  hypothetical protein  38.03 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.689478  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1058  hypothetical protein  34.96 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118135  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>