33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2873 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2731  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  262  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2873  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  262  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6143  hypothetical protein  91.34 
 
 		 127 aa  243  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2199  hypothetical protein  90.55 
 
 		 127 aa  238  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.699425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2813  hypothetical protein  90.55 
 
 		 127 aa  238  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0488  hypothetical protein  88.98 
 
 		 127 aa  236  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2824  hypothetical protein  89.76 
 
 		 127 aa  235  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0458  hypothetical protein  85.83 
 
 		 135 aa  224  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0105  hypothetical protein  86.51 
 
 		 127 aa  224  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516432  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0566  hypothetical protein  86.51 
 
 		 127 aa  224  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2912  hypothetical protein  86.51 
 
 		 127 aa  224  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1483  hypothetical protein  85.71 
 
 		 128 aa  221  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0550  hypothetical protein  85.71 
 
 		 128 aa  221  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906026  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0733  hypothetical protein  85.71 
 
 		 128 aa  221  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253076  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4144  hypothetical protein  74.19 
 
 		 127 aa  203  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0572  hypothetical protein  73.39 
 
 		 127 aa  201  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541327  hitchhiker  0.00799235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0303  hypothetical protein  70.63 
 
 		 127 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4536  hypothetical protein  32 
 
 		 157 aa  87.4  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251544  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.689478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0455  hypothetical protein  28.69 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1070  hypothetical protein  27.5 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00610238  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1730  hypothetical protein  32.08 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000217513  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3965  hypothetical protein  30.56 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0275074  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1519  hypothetical protein  27.68 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2457  hypothetical protein  30.39 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0270573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2472  hypothetical protein  27.73 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.435209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1798  hypothetical protein  31.71 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394364  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3105  hypothetical protein  30.19 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.965221  normal  0.584323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1556  hypothetical protein  32.23 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4907  hypothetical protein  30.63 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5108  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3771  hypothetical protein  24.37 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2101  hypothetical protein  26.85 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0911395  normal  0.606604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>