29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4272 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4272  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  247  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.967441  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4537  hypothetical protein  95.76 
 
 
119 aa  238  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3488  hypothetical protein  61.86 
 
 
119 aa  166  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2896  putative dehydrogenase  39.09 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2244  hypothetical protein  36.21 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0622  hypothetical protein  31.9 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5654  hypothetical protein  35.51 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.040863 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1331  hypothetical protein  29.2 
 
 
125 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0543  hypothetical protein  29.2 
 
 
125 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0612  hypothetical protein  29.2 
 
 
125 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0376517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3078  hypothetical protein  26.96 
 
 
128 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0813  hypothetical protein  29.2 
 
 
159 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.37773  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3606  hypothetical protein  27.35 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.84908  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2255  dehydrogenase  29.73 
 
 
128 aa  50.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.093096 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1535  hypothetical protein  28.32 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1559  hypothetical protein  28.32 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.571347  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0564  hypothetical protein  24.39 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.494906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2935  hypothetical protein  26.09 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2672  hypothetical protein  28.81 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1731  hypothetical protein  27.43 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3782  hypothetical protein  28.45 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00124046  normal  0.0210619 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0763  hypothetical protein  29.66 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7624  hypothetical protein  28.33 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.134101  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3993  hypothetical protein  24.11 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3904  hypothetical protein  29.57 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6220  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  29.82 
 
 
383 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4222  hypothetical protein  23.77 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184787  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2315  hypothetical protein  26.4 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2844  hypothetical protein  28.93 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00819039  normal  0.0885214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>