17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5654 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5654  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  266  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.040863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2896  putative dehydrogenase  67.46 
 
 		 132 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2255  dehydrogenase  46.73 
 
 		 128 aa  103  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6220  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  43.86 
 
 		 383 aa  93.2  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4537  hypothetical protein  37.27 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4272  hypothetical protein  35.51 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.967441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3488  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2244  hypothetical protein  30.58 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0622  hypothetical protein  29.32 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0564  hypothetical protein  30.56 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.494906 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3078  hypothetical protein  24.17 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7624  hypothetical protein  29.91 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.134101  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3782  hypothetical protein  31.4 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00124046  normal  0.0210619 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2935  hypothetical protein  26.83 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3904  hypothetical protein  30 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2834  hypothetical protein  32.11 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3113  hypothetical protein  27.2 
 
 		 157 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>