22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2244 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2244  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  260  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0622  hypothetical protein  77.78 
 
 		 127 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0564  hypothetical protein  42.74 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.494906 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3078  hypothetical protein  31.3 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2935  hypothetical protein  31.58 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4537  hypothetical protein  33.06 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4272  hypothetical protein  36.21 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.967441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3488  hypothetical protein  30.65 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3782  hypothetical protein  30 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00124046  normal  0.0210619 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5654  hypothetical protein  30.58 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.040863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4222  hypothetical protein  28.57 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2255  dehydrogenase  33.87 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2896  putative dehydrogenase  29.06 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6220  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.9 
 
 		 383 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2672  hypothetical protein  33.05 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1331  hypothetical protein  28.57 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0543  hypothetical protein  28.57 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0612  hypothetical protein  28.57 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0376517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0813  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.37773  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0763  hypothetical protein  27.97 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1535  hypothetical protein  29.41 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1559  hypothetical protein  29.41 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.571347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>