15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3782 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3782  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  326  8e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00124046  normal  0.0210619 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3078  hypothetical protein  44.07 
 
 		 128 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2935  hypothetical protein  43.22 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0564  hypothetical protein  33.91 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.494906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4222  hypothetical protein  29.82 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0763  hypothetical protein  31.09 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2244  hypothetical protein  30 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4537  hypothetical protein  32.23 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3488  hypothetical protein  33.04 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2672  hypothetical protein  29.31 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4272  hypothetical protein  28.45 
 
 		 119 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.967441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5654  hypothetical protein  31.4 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.040863 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3904  hypothetical protein  26.36 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0622  hypothetical protein  26.45 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2896  putative dehydrogenase  30.47 
 
 		 132 aa  44.3  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>