24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0763 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0763  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  265  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2672  hypothetical protein  69.3 
 
 
129 aa  176  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3904  hypothetical protein  51.38 
 
 
118 aa  123  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4575  hypothetical protein  31.67 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621123  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7624  hypothetical protein  36.75 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.134101  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3993  hypothetical protein  34.51 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2576  hypothetical protein  35.34 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.871718  normal  0.0119446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3782  hypothetical protein  31.09 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00124046  normal  0.0210619 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4554  hypothetical protein  31.53 
 
 
123 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2268  hypothetical protein  31.53 
 
 
123 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000109441  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4272  hypothetical protein  29.66 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.967441  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4537  hypothetical protein  28.57 
 
 
119 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3282  hypothetical protein  28.57 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.676398 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3488  hypothetical protein  30.17 
 
 
119 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3113  hypothetical protein  25.62 
 
 
157 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1535  hypothetical protein  26.96 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1559  hypothetical protein  26.96 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.571347  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0813  hypothetical protein  25.98 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.37773  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3078  hypothetical protein  24.37 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1731  hypothetical protein  25.2 
 
 
159 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2244  hypothetical protein  27.97 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1331  hypothetical protein  26.96 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0543  hypothetical protein  26.96 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0612  hypothetical protein  26.96 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0376517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>