28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4537 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4537  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  249  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4272  hypothetical protein  95.76 
 
 
119 aa  238  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.967441  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3488  hypothetical protein  61.86 
 
 
119 aa  165  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2896  putative dehydrogenase  40 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2244  hypothetical protein  33.06 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5654  hypothetical protein  37.27 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.040863 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0622  hypothetical protein  31.9 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2255  dehydrogenase  33.04 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.093096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3078  hypothetical protein  26.09 
 
 
128 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0564  hypothetical protein  26.02 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.494906 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1331  hypothetical protein  29.2 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0543  hypothetical protein  29.2 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0612  hypothetical protein  29.2 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0376517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0813  hypothetical protein  29.31 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.37773  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3782  hypothetical protein  32.23 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00124046  normal  0.0210619 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3606  hypothetical protein  27.35 
 
 
143 aa  51.6  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.84908  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1559  hypothetical protein  28.32 
 
 
125 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.571347  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1535  hypothetical protein  28.32 
 
 
125 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2935  hypothetical protein  25.22 
 
 
128 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1731  hypothetical protein  27.59 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0763  hypothetical protein  28.57 
 
 
127 aa  47.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2672  hypothetical protein  26.72 
 
 
129 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7624  hypothetical protein  27.35 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.134101  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2315  hypothetical protein  27.2 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3904  hypothetical protein  28.7 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3993  hypothetical protein  23.21 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4222  hypothetical protein  24.59 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184787  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6220  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  28.95 
 
 
383 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>