15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2896 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2896  putative dehydrogenase  100 
 
 
132 aa  275  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5654  hypothetical protein  67.46 
 
 
129 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.040863 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2255  dehydrogenase  45.67 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.093096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6220  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  41.82 
 
 
383 aa  87.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4537  hypothetical protein  40 
 
 
119 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4272  hypothetical protein  39.09 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.967441  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3488  hypothetical protein  35.24 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2244  hypothetical protein  29.06 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0564  hypothetical protein  30.28 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.494906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7624  hypothetical protein  28.97 
 
 
124 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.134101  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0622  hypothetical protein  29.69 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3782  hypothetical protein  30.47 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00124046  normal  0.0210619 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3904  hypothetical protein  27.73 
 
 
118 aa  42.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2834  hypothetical protein  32.73 
 
 
154 aa  40.4  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3078  hypothetical protein  23.08 
 
 
128 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>