33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3488 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3488  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  244  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4272  hypothetical protein  61.86 
 
 		 119 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.967441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4537  hypothetical protein  61.86 
 
 		 119 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2896  putative dehydrogenase  35.24 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2244  hypothetical protein  30.65 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5654  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.040863 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0622  hypothetical protein  26.4 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3078  hypothetical protein  26.72 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2935  hypothetical protein  27.59 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1331  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0543  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0612  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0376517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0813  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.37773  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3606  hypothetical protein  28.81 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.84908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3993  hypothetical protein  28.95 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2255  dehydrogenase  28.95 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3782  hypothetical protein  33.04 
 
 		 158 aa  50.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00124046  normal  0.0210619 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1535  hypothetical protein  32.5 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1559  hypothetical protein  32.5 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.571347  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0564  hypothetical protein  26.5 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.494906 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1731  hypothetical protein  31.67 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2672  hypothetical protein  27.97 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0763  hypothetical protein  30.17 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7624  hypothetical protein  26.5 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.134101  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2268  hypothetical protein  28.7 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000109441  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4554  hypothetical protein  28.7 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3282  hypothetical protein  23.73 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.676398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0022  hypothetical protein  26.55 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831793  normal  0.341515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6220  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  26.72 
 
 		 383 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2576  hypothetical protein  25.89 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.871718  normal  0.0119446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2315  hypothetical protein  23.68 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3904  hypothetical protein  27.83 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4575  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621123  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>