26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7624 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7624  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  254  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.134101  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2576  hypothetical protein  41.13 
 
 
128 aa  94.4  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.871718  normal  0.0119446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2993  hypothetical protein  26.96 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597876 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1559  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.571347  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1535  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0612  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0376517  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0543  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1331  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0763  hypothetical protein  36.75 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1731  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0813  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.37773  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3904  hypothetical protein  34.96 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0022  hypothetical protein  28.07 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831793  normal  0.341515 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4554  hypothetical protein  30.36 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2268  hypothetical protein  30.36 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000109441  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2672  hypothetical protein  33.06 
 
 
129 aa  57.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3282  hypothetical protein  25.64 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.676398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4575  hypothetical protein  30.7 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621123  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5654  hypothetical protein  29.91 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.040863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3993  hypothetical protein  31.48 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2834  hypothetical protein  29.41 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2896  putative dehydrogenase  28.97 
 
 
132 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3488  hypothetical protein  26.5 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4272  hypothetical protein  28.33 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.967441  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4537  hypothetical protein  27.35 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3113  hypothetical protein  28.69 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>