16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3282 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3282  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  261  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.676398 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2576  hypothetical protein  40.34 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.871718  normal  0.0119446 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1331  hypothetical protein  27.88 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0543  hypothetical protein  27.88 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0612  hypothetical protein  27.88 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0376517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0813  hypothetical protein  27.88 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.37773  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1731  hypothetical protein  26.92 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1535  hypothetical protein  26.92 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1559  hypothetical protein  26.92 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.571347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7624  hypothetical protein  25.64 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.134101  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2672  hypothetical protein  28.81 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0763  hypothetical protein  28.57 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3488  hypothetical protein  23.73 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3904  hypothetical protein  21.74 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2993  hypothetical protein  24.58 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.597876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3993  hypothetical protein  23.81 
 
 		 149 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>