18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3904 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008739  Maqu_3904  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  249  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0763  hypothetical protein  51.38 
 
 
127 aa  123  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2672  hypothetical protein  46.79 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7624  hypothetical protein  34.96 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.134101  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2576  hypothetical protein  33.9 
 
 
128 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.871718  normal  0.0119446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4575  hypothetical protein  28.44 
 
 
150 aa  58.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621123  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3993  hypothetical protein  32.41 
 
 
149 aa  58.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5654  hypothetical protein  30 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.040863 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2834  hypothetical protein  28.45 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3782  hypothetical protein  26.36 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00124046  normal  0.0210619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4272  hypothetical protein  29.57 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.967441  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3282  hypothetical protein  21.74 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.676398 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4537  hypothetical protein  28.7 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2268  hypothetical protein  26.09 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000109441  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4554  hypothetical protein  26.09 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2896  putative dehydrogenase  27.73 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3488  hypothetical protein  27.83 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3606  hypothetical protein  28.21 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.84908  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>