16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0947 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0947  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1798  hypothetical protein  30.46 
 
 
166 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394364  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1556  hypothetical protein  32.41 
 
 
130 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1000  hypothetical protein  26.67 
 
 
131 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5077  hypothetical protein  30.77 
 
 
146 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2098  hypothetical protein  28.1 
 
 
117 aa  46.2  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00841616  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0528  hypothetical protein  25.64 
 
 
121 aa  45.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1879  putative secreted protein  25.83 
 
 
137 aa  45.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562565  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0150  hypothetical protein  29.41 
 
 
158 aa  44.7  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3374  hypothetical protein  29.17 
 
 
146 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000282679  hitchhiker  0.0000000000090081 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5301  hypothetical protein  27.78 
 
 
126 aa  42.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3057  hypothetical protein  24.31 
 
 
215 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975792 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1428  hypothetical protein  25.66 
 
 
122 aa  42  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0545971  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0043  hypothetical protein  31.46 
 
 
134 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.456021  normal  0.419625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0455  hypothetical protein  21.92 
 
 
144 aa  41.6  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596707  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0148  hypothetical protein  30.69 
 
 
153 aa  41.2  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>