More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04963 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.42 
 
 
697 aa  647    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.42 
 
 
703 aa  664    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3378  type III secretion FHIPEP protein  56.35 
 
 
579 aa  662    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3485  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.82 
 
 
693 aa  841    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4344  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.19 
 
 
709 aa  649    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.64 
 
 
699 aa  655    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0241  lateral flagellar export/assembly protein LfhA  60 
 
 
697 aa  838    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.06 
 
 
705 aa  696    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6779  type III secretion FHIPEP protein  56.29 
 
 
696 aa  768    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.702443  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1976  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.04 
 
 
709 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0869734  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0211  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.75 
 
 
696 aa  788    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2808  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.9 
 
 
715 aa  653    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18652  normal  0.0746951 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3440  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.45 
 
 
709 aa  641    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00228  hypothetical protein  56.47 
 
 
570 aa  660    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4644  type III secretion FHIPEP protein  56.58 
 
 
696 aa  760    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207433  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.5 
 
 
699 aa  659    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.23 
 
 
710 aa  649    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.5 
 
 
699 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.52 
 
 
690 aa  640    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1560  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.93 
 
 
709 aa  662    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0243  flagellar biosynthesis protein FlhA  61.58 
 
 
698 aa  848    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0111317 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.5 
 
 
699 aa  653    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.79 
 
 
697 aa  669    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0702  flagellar biosynthesis protein FlhA  61.88 
 
 
697 aa  853    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.628209  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0622  flagellar biosynthesis protein FlhA  61.73 
 
 
698 aa  854    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0163  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.27 
 
 
696 aa  777    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001176  flagellar biosynthesis protein FlhA  94.11 
 
 
696 aa  1235    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3988  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.75 
 
 
697 aa  834    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1523  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.19 
 
 
748 aa  649    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403932  normal  0.346987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.43 
 
 
699 aa  654    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.5 
 
 
699 aa  654    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3875  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.53 
 
 
707 aa  662    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.29 
 
 
700 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1340  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.93 
 
 
699 aa  645    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3668  flagellar biosynthesis protein FlhA  63.54 
 
 
693 aa  818    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.65 
 
 
697 aa  651    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04963  flagellar biosynthesis pathway, component FlhA  100 
 
 
696 aa  1403    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3670  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.63 
 
 
709 aa  655    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.36 
 
 
700 aa  674    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.21 
 
 
699 aa  654    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.21 
 
 
699 aa  654    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1196  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.21 
 
 
699 aa  639    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.57 
 
 
699 aa  641    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0274  type III secretion protein, FHIPEP family  56.42 
 
 
579 aa  664    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.807219 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.64 
 
 
699 aa  655    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.36 
 
 
699 aa  651    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45680  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.68 
 
 
707 aa  661    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.589215 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0093  flagellar biosynthesis protein FlhA  63.13 
 
 
693 aa  869    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.36 
 
 
699 aa  655    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3391  type III secretion FHIPEP protein  60 
 
 
697 aa  838    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0263  protein FhiA  56.17 
 
 
579 aa  660    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0259  FHIPEP family type III secretion protein  56.25 
 
 
579 aa  661    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3597  type III secretion FHIPEP protein  58.54 
 
 
695 aa  853    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.69729  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1978  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.16 
 
 
724 aa  649    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4426  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.75 
 
 
698 aa  895    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.47767 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0087  flagellar biosynthesis protein FlhA  63.31 
 
 
693 aa  898    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0364653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.88 
 
 
702 aa  633  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.93 
 
 
699 aa  632  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1657  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.07 
 
 
697 aa  629  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0357682  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.36 
 
 
699 aa  626  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.84 
 
 
706 aa  627  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1516  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.22 
 
 
700 aa  623  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3213  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.93 
 
 
699 aa  623  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1749  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.58 
 
 
692 aa  619  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1749  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.72 
 
 
692 aa  620  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3913  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.04 
 
 
709 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11934  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2167  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.14 
 
 
755 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  47.22 
 
 
696 aa  600  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.92 
 
 
693 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.65 
 
 
690 aa  595  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.83 
 
 
708 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.83 
 
 
708 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.7 
 
 
699 aa  585  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3707  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.7 
 
 
693 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306788  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.46 
 
 
694 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.46 
 
 
694 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1246  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.57 
 
 
692 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.932165  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.16 
 
 
698 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.1 
 
 
698 aa  572  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06205  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.52 
 
 
684 aa  569  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.127059  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00961  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.52 
 
 
684 aa  569  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.21205  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.19 
 
 
695 aa  569  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.3 
 
 
693 aa  569  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.5 
 
 
700 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.33 
 
 
695 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4141  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.16 
 
 
697 aa  564  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.303073  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4413  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.76 
 
 
693 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402008  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  45.31 
 
 
694 aa  560  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0931  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.5 
 
 
697 aa  561  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.36 
 
 
700 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.36 
 
 
692 aa  561  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1310  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.57 
 
 
692 aa  556  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.933985  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.99 
 
 
700 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.99 
 
 
700 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.99 
 
 
700 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0195  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.9 
 
 
700 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107813  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.99 
 
 
700 aa  555  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0182  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.46 
 
 
700 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0176  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.87 
 
 
700 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117653  normal  0.17502 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.99 
 
 
700 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>