More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3597 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6779  type III secretion FHIPEP protein  47.42 
 
 
696 aa  672    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.702443  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3988  flagellar biosynthesis protein FlhA  54.86 
 
 
697 aa  682    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4644  type III secretion FHIPEP protein  47.99 
 
 
696 aa  668    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207433  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0211  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.21 
 
 
696 aa  707    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001176  flagellar biosynthesis protein FlhA  59.11 
 
 
696 aa  776    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4426  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.63 
 
 
698 aa  734    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.47767 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0243  flagellar biosynthesis protein FlhA  53.59 
 
 
698 aa  737    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0111317 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04963  flagellar biosynthesis pathway, component FlhA  58.54 
 
 
696 aa  791    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0163  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.07 
 
 
696 aa  689    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0241  lateral flagellar export/assembly protein LfhA  53.07 
 
 
697 aa  745    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3668  flagellar biosynthesis protein FlhA  54.45 
 
 
693 aa  664    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0087  flagellar biosynthesis protein FlhA  54.68 
 
 
693 aa  743    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0364653 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0702  flagellar biosynthesis protein FlhA  53.73 
 
 
697 aa  739    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.628209  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3391  type III secretion FHIPEP protein  53.07 
 
 
697 aa  747    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0622  flagellar biosynthesis protein FlhA  53.59 
 
 
698 aa  739    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3485  flagellar biosynthesis protein FlhA  54.02 
 
 
693 aa  687    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3597  type III secretion FHIPEP protein  100 
 
 
695 aa  1380    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.69729  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0093  flagellar biosynthesis protein FlhA  54.39 
 
 
693 aa  709    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.57 
 
 
705 aa  619  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3670  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.71 
 
 
709 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0259  FHIPEP family type III secretion protein  49.04 
 
 
579 aa  585  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1523  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.66 
 
 
748 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403932  normal  0.346987 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0274  type III secretion protein, FHIPEP family  49.22 
 
 
579 aa  587  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.807219 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3378  type III secretion FHIPEP protein  49.13 
 
 
579 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4344  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.71 
 
 
709 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0263  protein FhiA  49.04 
 
 
579 aa  585  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00228  hypothetical protein  49.22 
 
 
570 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.19 
 
 
697 aa  580  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1560  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.73 
 
 
709 aa  581  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.4 
 
 
699 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.4 
 
 
699 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.68 
 
 
699 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.4 
 
 
699 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.86 
 
 
699 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.4 
 
 
699 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.25 
 
 
699 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.43 
 
 
700 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45680  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.04 
 
 
707 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.589215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.25 
 
 
699 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3875  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.9 
 
 
707 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.4 
 
 
699 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.04 
 
 
697 aa  572  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.12 
 
 
703 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.98 
 
 
699 aa  571  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.69 
 
 
699 aa  569  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.51 
 
 
699 aa  570  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1976  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.82 
 
 
709 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0869734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3440  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.67 
 
 
709 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.38 
 
 
700 aa  568  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1978  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.36 
 
 
724 aa  565  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.57 
 
 
710 aa  565  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.38 
 
 
699 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  43.09 
 
 
696 aa  561  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2808  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.4 
 
 
715 aa  559  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18652  normal  0.0746951 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.33 
 
 
697 aa  557  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.28 
 
 
693 aa  557  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1657  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.06 
 
 
697 aa  553  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0357682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1340  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.68 
 
 
699 aa  553  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.52 
 
 
706 aa  553  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3213  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.54 
 
 
699 aa  549  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.92 
 
 
708 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.92 
 
 
708 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.45 
 
 
698 aa  549  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.42 
 
 
699 aa  546  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.34 
 
 
698 aa  548  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3913  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.14 
 
 
709 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11934  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1749  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.85 
 
 
692 aa  542  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.44 
 
 
690 aa  543  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.4 
 
 
690 aa  544  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1516  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.17 
 
 
700 aa  539  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.78 
 
 
702 aa  538  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1749  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.56 
 
 
692 aa  539  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.5 
 
 
695 aa  539  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1196  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.11 
 
 
699 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.48 
 
 
700 aa  534  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.62 
 
 
693 aa  534  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.33 
 
 
700 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.33 
 
 
700 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.33 
 
 
700 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.33 
 
 
700 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.33 
 
 
700 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.33 
 
 
700 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.33 
 
 
700 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.64 
 
 
695 aa  528  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.04 
 
 
692 aa  528  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.88 
 
 
700 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0176  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.24 
 
 
700 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117653  normal  0.17502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  42.18 
 
 
694 aa  522  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.72 
 
 
699 aa  525  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2167  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.56 
 
 
755 aa  521  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0195  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.88 
 
 
700 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107813  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0182  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.73 
 
 
700 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0250  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.83 
 
 
700 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253227  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3371  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.83 
 
 
699 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029273  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  43 
 
 
700 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2839  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.83 
 
 
700 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.753439  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0268  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.83 
 
 
700 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0416492  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0740  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.31 
 
 
694 aa  509  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1246  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.33 
 
 
692 aa  511  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.932165  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4141  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.65 
 
 
697 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.303073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>