29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0834 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0834  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  592  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.430945  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4132  hypothetical protein  29.93 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3623  hypothetical protein  30.72 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2824  hypothetical protein  24.15 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.266593  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3973  hypothetical protein  27.03 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.250677 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0110  hypothetical protein  27.09 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1267  hypothetical protein  30.43 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1445  hypothetical protein  31.62 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3855  hypothetical protein  30.53 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5707  hypothetical protein  27.75 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.045893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0455  hypothetical protein  29.3 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4416  hypothetical protein  31.17 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1726  hypothetical protein  31.17 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978889 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1009  hypothetical protein  25.28 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1137  hypothetical protein  25.88 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2938  hypothetical protein  28.74 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0676403  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3092  hypothetical protein  29.3 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0671973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2333  hypothetical protein  26.54 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.0456221 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3714  hypothetical protein  24 
 
 		 295 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2463  hypothetical protein  23.3 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2017  hypothetical protein  25.86 
 
 		 315 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.02732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3372  hypothetical protein  24.89 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000516868  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002226  hypothetical protein  27.06 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003214  hypothetical protein  30.89 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2826  hypothetical protein  26.98 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2747  hypothetical protein  29.14 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3901  hypothetical protein  28.57 
 
 		 389 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.257798  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3073  hypothetical protein  19.3 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00754966  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03608  hypothetical protein  25.98 
 
 		 276 aa  43.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>