17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1445 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1445  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  661    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352294  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2938  hypothetical protein  44.87 
 
 		 345 aa  281  8.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0676403  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0834  hypothetical protein  31.62 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.430945  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4132  hypothetical protein  32.21 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002226  hypothetical protein  30.12 
 
 		 270 aa  57  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1009  hypothetical protein  29.27 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3453  hypothetical protein  30.77 
 
 		 201 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000598107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3973  hypothetical protein  25.75 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.250677 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1137  hypothetical protein  30.43 
 
 		 287 aa  53.1  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2824  hypothetical protein  29.66 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.266593  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1267  hypothetical protein  29.6 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003214  hypothetical protein  29.63 
 
 		 271 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2456  hypothetical protein  30.43 
 
 		 199 aa  47  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0110  hypothetical protein  26.63 
 
 		 299 aa  47  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2333  hypothetical protein  60 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.0456221 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3092  hypothetical protein  26.72 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0671973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3372  hypothetical protein  46.81 
 
 		 268 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000516868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>