25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003214 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003214  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  568  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2333  hypothetical protein  25.37 
 
 		 248 aa  90.5  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.0456221 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0110  hypothetical protein  27.8 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4132  hypothetical protein  28.88 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3092  hypothetical protein  24.9 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0671973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2824  hypothetical protein  25.69 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.266593  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1009  hypothetical protein  24.14 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3453  hypothetical protein  32.38 
 
 		 201 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000598107 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1137  hypothetical protein  24.48 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2463  hypothetical protein  24.53 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2747  hypothetical protein  24.15 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1267  hypothetical protein  30.63 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002226  hypothetical protein  27.89 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3855  hypothetical protein  25.28 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2826  hypothetical protein  29.31 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2017  hypothetical protein  23.47 
 
 		 315 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.02732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2456  hypothetical protein  23.16 
 
 		 199 aa  49.3  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03608  hypothetical protein  25.1 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1445  hypothetical protein  29.63 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2026  hypothetical protein  22.18 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.958277  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0834  hypothetical protein  30.89 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.430945  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0455  hypothetical protein  24.71 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3372  hypothetical protein  21.4 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000516868  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2938  hypothetical protein  33.03 
 
 		 345 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0676403  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5707  hypothetical protein  22.35 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.045893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>