27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2824 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2824  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.266593  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1137  hypothetical protein  29 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0110  hypothetical protein  25.71 
 
 		 299 aa  88.2  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2333  hypothetical protein  29.6 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.0456221 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3073  hypothetical protein  26.89 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00754966  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3092  hypothetical protein  26.1 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0671973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2017  hypothetical protein  29.33 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.02732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4132  hypothetical protein  24.68 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0834  hypothetical protein  24.15 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.430945  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1009  hypothetical protein  29 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002226  hypothetical protein  26.83 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3973  hypothetical protein  24.34 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.250677 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003214  hypothetical protein  25.69 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2463  hypothetical protein  28.4 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2747  hypothetical protein  25.26 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2026  hypothetical protein  25.45 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.958277  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3855  hypothetical protein  24.7 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4416  hypothetical protein  25.28 
 
 		 305 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1726  hypothetical protein  25.28 
 
 		 305 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978889 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3372  hypothetical protein  25.81 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000516868  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2938  hypothetical protein  27.27 
 
 		 345 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0676403  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1445  hypothetical protein  29.66 
 
 		 320 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1267  hypothetical protein  25.15 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3623  hypothetical protein  24.32 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2826  hypothetical protein  24.14 
 
 		 215 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0455  hypothetical protein  26.7 
 
 		 306 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03608  hypothetical protein  23.05 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>