19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3073 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3073  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  663    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00754966  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0110  hypothetical protein  26.94 
 
 
299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1137  hypothetical protein  27.61 
 
 
287 aa  99  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2333  hypothetical protein  26.39 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.0456221 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2824  hypothetical protein  26.89 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.266593  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3092  hypothetical protein  30.52 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0671973  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1009  hypothetical protein  28.05 
 
 
268 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3372  hypothetical protein  26.79 
 
 
268 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000516868  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3714  hypothetical protein  22.38 
 
 
295 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4132  hypothetical protein  27.03 
 
 
281 aa  59.3  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3855  hypothetical protein  24.62 
 
 
225 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5707  hypothetical protein  29.33 
 
 
247 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.045893  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1267  hypothetical protein  28.32 
 
 
314 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2017  hypothetical protein  22.28 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.02732 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2463  hypothetical protein  23.7 
 
 
276 aa  50.4  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002226  hypothetical protein  28.57 
 
 
270 aa  43.9  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0834  hypothetical protein  19.3 
 
 
285 aa  43.5  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.430945  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03608  hypothetical protein  21.52 
 
 
276 aa  43.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3453  hypothetical protein  23.66 
 
 
201 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000598107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>