11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3714 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3714  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  608  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3073  hypothetical protein  22.38 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00754966  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3372  hypothetical protein  24.7 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000516868  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0834  hypothetical protein  24 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.430945  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03608  hypothetical protein  20.58 
 
 		 276 aa  49.3  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1267  hypothetical protein  23.21 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2026  hypothetical protein  23.16 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.958277  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3855  hypothetical protein  26.19 
 
 		 225 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2747  hypothetical protein  26.39 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3092  hypothetical protein  21.65 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0671973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4132  hypothetical protein  23.46 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>