28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1267 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1267  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0110  hypothetical protein  34.69 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0834  hypothetical protein  30.43 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.430945  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0455  hypothetical protein  31.06 
 
 
306 aa  60.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1009  hypothetical protein  21.79 
 
 
268 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2017  hypothetical protein  24.87 
 
 
315 aa  59.3  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.02732 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03608  hypothetical protein  22.54 
 
 
276 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1137  hypothetical protein  31.25 
 
 
287 aa  58.9  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4132  hypothetical protein  23.32 
 
 
281 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003214  hypothetical protein  30.63 
 
 
271 aa  56.6  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5707  hypothetical protein  29.63 
 
 
247 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.045893  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2026  hypothetical protein  23.03 
 
 
285 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.958277  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4416  hypothetical protein  28.68 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1726  hypothetical protein  28.68 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00978889 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2333  hypothetical protein  31.43 
 
 
248 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.0456221 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2463  hypothetical protein  28.47 
 
 
276 aa  53.1  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3073  hypothetical protein  28.32 
 
 
317 aa  53.1  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00754966  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002226  hypothetical protein  31.3 
 
 
270 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3973  hypothetical protein  23.53 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.250677 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2747  hypothetical protein  27.32 
 
 
275 aa  50.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3855  hypothetical protein  27.41 
 
 
225 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3901  hypothetical protein  24.42 
 
 
389 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.257798  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3714  hypothetical protein  23.21 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2824  hypothetical protein  25.15 
 
 
260 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.266593  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1445  hypothetical protein  29.6 
 
 
320 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352294  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3092  hypothetical protein  20.29 
 
 
327 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0671973  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2826  hypothetical protein  26.56 
 
 
215 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3623  hypothetical protein  25 
 
 
308 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>