28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3855 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3855  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  470  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5707  hypothetical protein  63.47 
 
 
247 aa  291  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.045893  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2826  hypothetical protein  33.33 
 
 
215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0834  hypothetical protein  30.53 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.430945  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002226  hypothetical protein  28.65 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4132  hypothetical protein  25 
 
 
281 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3073  hypothetical protein  24.62 
 
 
317 aa  58.5  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00754966  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2824  hypothetical protein  24.7 
 
 
260 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.266593  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003214  hypothetical protein  25.28 
 
 
271 aa  55.1  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2017  hypothetical protein  24.42 
 
 
315 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.02732 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4416  hypothetical protein  27.59 
 
 
305 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1726  hypothetical protein  27.59 
 
 
305 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00978889 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1009  hypothetical protein  28.03 
 
 
268 aa  53.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3453  hypothetical protein  24.21 
 
 
201 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000598107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0455  hypothetical protein  26.96 
 
 
306 aa  52.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0110  hypothetical protein  27.78 
 
 
299 aa  52.4  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3372  hypothetical protein  25.16 
 
 
268 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000516868  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2456  hypothetical protein  28.95 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110138  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3092  hypothetical protein  27.44 
 
 
327 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0671973  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1267  hypothetical protein  27.41 
 
 
314 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1137  hypothetical protein  28.33 
 
 
287 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3714  hypothetical protein  26.19 
 
 
295 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3623  hypothetical protein  27.12 
 
 
308 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2938  hypothetical protein  33.87 
 
 
345 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0676403  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3901  hypothetical protein  33.93 
 
 
389 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.257798  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2333  hypothetical protein  29.17 
 
 
248 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.0456221 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1445  hypothetical protein  30.26 
 
 
320 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352294  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2463  hypothetical protein  23.49 
 
 
276 aa  42  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>