26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3092 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3092  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  676    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0671973  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1137  hypothetical protein  32.95 
 
 
287 aa  157  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0110  hypothetical protein  26.97 
 
 
299 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2333  hypothetical protein  29.96 
 
 
248 aa  90.1  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.0456221 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2824  hypothetical protein  26.1 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.266593  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3073  hypothetical protein  30.52 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00754966  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1009  hypothetical protein  27.24 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4132  hypothetical protein  26.69 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003214  hypothetical protein  24.9 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2017  hypothetical protein  27.64 
 
 
315 aa  63.5  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.02732 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0834  hypothetical protein  29.3 
 
 
285 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.430945  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2747  hypothetical protein  23.72 
 
 
275 aa  53.1  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3372  hypothetical protein  21.57 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000516868  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2463  hypothetical protein  23.11 
 
 
276 aa  50.4  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3855  hypothetical protein  27.44 
 
 
225 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3453  hypothetical protein  27.94 
 
 
201 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000598107 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2906  hypothetical protein  22.04 
 
 
480 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2826  hypothetical protein  36.47 
 
 
215 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2456  hypothetical protein  31.78 
 
 
199 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110138  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03608  hypothetical protein  23.36 
 
 
276 aa  47  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002226  hypothetical protein  26.72 
 
 
270 aa  46.2  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1445  hypothetical protein  26.72 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352294  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3714  hypothetical protein  21.65 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1267  hypothetical protein  20.29 
 
 
314 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2026  hypothetical protein  21.15 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.958277  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2938  hypothetical protein  41.86 
 
 
345 aa  43.1  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0676403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>