15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2938 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2938  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  714    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0676403  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1445  hypothetical protein  44.87 
 
 		 320 aa  281  9e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0834  hypothetical protein  28.74 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.430945  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002226  hypothetical protein  28.24 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4132  hypothetical protein  28.87 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3453  hypothetical protein  30.99 
 
 		 201 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000598107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2824  hypothetical protein  27.27 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.266593  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2333  hypothetical protein  43.94 
 
 		 248 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.0456221 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1009  hypothetical protein  26.43 
 
 		 268 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1137  hypothetical protein  53.12 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3855  hypothetical protein  33.87 
 
 		 225 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003214  hypothetical protein  33.03 
 
 		 271 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3092  hypothetical protein  41.86 
 
 		 327 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0671973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1417  hypothetical protein  24.31 
 
 		 394 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1446  hypothetical protein  24.31 
 
 		 394 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>