25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4132 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_4132  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0834  hypothetical protein  29.93 
 
 
285 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.430945  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2333  hypothetical protein  25.52 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.0456221 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1009  hypothetical protein  27.84 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003214  hypothetical protein  28.88 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2824  hypothetical protein  24.68 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.266593  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3092  hypothetical protein  26.69 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0671973  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0110  hypothetical protein  25.46 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2747  hypothetical protein  22.37 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3973  hypothetical protein  23.32 
 
 
261 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.250677 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5707  hypothetical protein  31.3 
 
 
247 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.045893  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1445  hypothetical protein  32.21 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352294  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3073  hypothetical protein  27.03 
 
 
317 aa  59.3  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00754966  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3855  hypothetical protein  25 
 
 
225 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03608  hypothetical protein  26.34 
 
 
276 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1267  hypothetical protein  23.32 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2017  hypothetical protein  25 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.02732 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002226  hypothetical protein  31.01 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3453  hypothetical protein  28.79 
 
 
201 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000598107 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2938  hypothetical protein  28.87 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0676403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2456  hypothetical protein  26.16 
 
 
199 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110138  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2826  hypothetical protein  26.43 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1137  hypothetical protein  24.19 
 
 
287 aa  47  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3901  hypothetical protein  37.84 
 
 
389 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.257798  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3714  hypothetical protein  23.46 
 
 
295 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>