18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2456 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2456  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  408  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3453  hypothetical protein  53.81 
 
 		 201 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000598107 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1137  hypothetical protein  23.89 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3855  hypothetical protein  28.95 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4132  hypothetical protein  26.16 
 
 		 281 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003214  hypothetical protein  23.16 
 
 		 271 aa  49.3  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5707  hypothetical protein  29.14 
 
 		 247 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.045893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2826  hypothetical protein  25.95 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1445  hypothetical protein  30.43 
 
 		 320 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3092  hypothetical protein  31.78 
 
 		 327 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0671973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002226  hypothetical protein  25 
 
 		 270 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2333  hypothetical protein  26.12 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.0456221 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2747  hypothetical protein  23.57 
 
 		 275 aa  42  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2463  hypothetical protein  23.74 
 
 		 276 aa  42  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1267  hypothetical protein  26.26 
 
 		 314 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03608  hypothetical protein  21.89 
 
 		 276 aa  42  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3901  hypothetical protein  24.67 
 
 		 389 aa  41.2  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.257798  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0110  hypothetical protein  21.84 
 
 		 299 aa  41.2  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>