19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002226 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002226  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2824  hypothetical protein  26.83 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.266593  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3855  hypothetical protein  28.65 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4132  hypothetical protein  31.01 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1445  hypothetical protein  30.12 
 
 		 320 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003214  hypothetical protein  27.89 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5707  hypothetical protein  23.19 
 
 		 247 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.045893  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2938  hypothetical protein  28.24 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0676403  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1267  hypothetical protein  31.3 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2826  hypothetical protein  23.12 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1137  hypothetical protein  29.66 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0834  hypothetical protein  27.06 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.430945  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3973  hypothetical protein  26.29 
 
 		 261 aa  46.6  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.250677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2456  hypothetical protein  25 
 
 		 199 aa  46.6  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3092  hypothetical protein  26.72 
 
 		 327 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0671973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03608  hypothetical protein  25.75 
 
 		 276 aa  46.2  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1009  hypothetical protein  21.33 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3073  hypothetical protein  28.57 
 
 		 317 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00754966  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0455  hypothetical protein  29.91 
 
 		 306 aa  42.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>