22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03608 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03608  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2747  hypothetical protein  44.4 
 
 
275 aa  235  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3372  hypothetical protein  28.72 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000516868  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1137  hypothetical protein  26.09 
 
 
287 aa  64.7  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4416  hypothetical protein  28.57 
 
 
305 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1726  hypothetical protein  28.57 
 
 
305 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00978889 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1009  hypothetical protein  24.43 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1267  hypothetical protein  22.54 
 
 
314 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4132  hypothetical protein  26.34 
 
 
281 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2333  hypothetical protein  28.95 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.0456221 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3714  hypothetical protein  20.58 
 
 
295 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003214  hypothetical protein  25.1 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0110  hypothetical protein  25.37 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3092  hypothetical protein  23.36 
 
 
327 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0671973  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1980  hypothetical protein  26.09 
 
 
507 aa  47  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002226  hypothetical protein  25.75 
 
 
270 aa  46.2  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2824  hypothetical protein  23.05 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.266593  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3901  hypothetical protein  24.32 
 
 
389 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.257798  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0834  hypothetical protein  25.98 
 
 
285 aa  43.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.430945  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3073  hypothetical protein  21.52 
 
 
317 aa  43.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00754966  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0455  hypothetical protein  27.04 
 
 
306 aa  42.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5707  hypothetical protein  28.17 
 
 
247 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.045893  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>