18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4416 on replicon NC_011664
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011664  Sbal223_4416  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  638    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1726  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  638    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00978889 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0455  hypothetical protein  59.34 
 
 
306 aa  401  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3623  hypothetical protein  42.9 
 
 
308 aa  267  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03608  hypothetical protein  28.57 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0834  hypothetical protein  31.17 
 
 
285 aa  60.1  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.430945  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1137  hypothetical protein  24.71 
 
 
287 aa  59.7  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1267  hypothetical protein  28.68 
 
 
314 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2333  hypothetical protein  27.54 
 
 
248 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.0456221 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3855  hypothetical protein  27.59 
 
 
225 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2824  hypothetical protein  25.28 
 
 
260 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.266593  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2826  hypothetical protein  30.28 
 
 
215 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5707  hypothetical protein  25 
 
 
247 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.045893  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2747  hypothetical protein  28.1 
 
 
275 aa  50.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2026  hypothetical protein  23.21 
 
 
285 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.958277  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3372  hypothetical protein  29.19 
 
 
268 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000516868  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2463  hypothetical protein  21.62 
 
 
276 aa  42.4  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1162  hypothetical protein  22.87 
 
 
283 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>