20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2017 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2017  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.02732 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1009  hypothetical protein  21.83 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2824  hypothetical protein  29.33 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.266593  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0110  hypothetical protein  22.08 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1137  hypothetical protein  25.97 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3092  hypothetical protein  27.64 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0671973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2333  hypothetical protein  28.5 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.0456221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3372  hypothetical protein  22.82 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000516868  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1267  hypothetical protein  24.87 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4132  hypothetical protein  25 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2463  hypothetical protein  22.59 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3855  hypothetical protein  24.42 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3073  hypothetical protein  22.28 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00754966  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5707  hypothetical protein  27.47 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.045893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003214  hypothetical protein  23.47 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0834  hypothetical protein  25.86 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.430945  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3453  hypothetical protein  25 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000598107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2826  hypothetical protein  27.84 
 
 		 215 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2026  hypothetical protein  21.51 
 
 		 285 aa  46.2  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.958277  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2747  hypothetical protein  22.36 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>