102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2295 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2295  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
92 aa  175  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  43.96 
 
 
243 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  45 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  45.88 
 
 
289 aa  68.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1412  HspR protein, putative  43.42 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.18212  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1219  MerR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
101 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.100212  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1193  transcriptional regulator, MerR family  41.03 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0554847  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  34.52 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  37.97 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  40.22 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1381  regulatory protein MerR  38.64 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
124 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  38.1 
 
 
123 aa  57  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  36.9 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0443  transcriptional regulator, MerR family  38.37 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  32.93 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0526  putative transcriptional regulator, MerR family  41.77 
 
 
115 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
201 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0787  MerR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
136 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.877996  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  36.9 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4230  putative transcriptional regulator, MerR family  34.09 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0585976  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0244  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.448953 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5468  transcriptional regulator, MerR family  36.25 
 
 
161 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0052  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 
157 aa  51.2  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
120 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  34.44 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
169 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 
140 aa  50.4  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  36.25 
 
 
152 aa  50.4  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  37.5 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0555  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  33.75 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
205 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  32.47 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  36.59 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
150 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  34.94 
 
 
195 aa  46.2  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0425  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0116  MerR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1215  transcriptional regulator, MerR family  31.96 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.460716  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  36.59 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0115  MerR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4436  regulatory protein MerR  33.75 
 
 
109 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.465157  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  33.68 
 
 
255 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2593  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0365897  normal  0.180328 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  31.71 
 
 
143 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0262  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.143032  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  32.5 
 
 
156 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  33.72 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1521  hypothetical protein  55 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
188 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  27.47 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0360  MerR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000341554  normal  0.726839 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5494  transcriptional regulator, MerR family  32.05 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4233  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  26.37 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  36.71 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2006  hypothetical protein  26.74 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0151829  normal  0.258425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4804  transcriptional regulator, MerR family  30.49 
 
 
152 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2373  hypothetical protein  31.67 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  38.96 
 
 
183 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6364  hypothetical protein  44.9 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.278619  normal  0.148278 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3909  hypothetical protein  34.48 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5307  hypothetical protein  47.5 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.699628 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  35.96 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3804  hypothetical protein  25 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.1669 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
166 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1816  MerR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
154 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0245036  normal  0.855302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
179 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0352  transcriptional regulator, MerR family  41.03 
 
 
180 aa  40.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3755  hypothetical protein  30.14 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0821267  normal  0.731479 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>