17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3804 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3804  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  194  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.1669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2373  hypothetical protein  44.79 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0543  hypothetical protein  40.62 
 
 
99 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.918595  normal  0.716704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5707  hypothetical protein  35.42 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.189516 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2675  hypothetical protein  34.78 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246513  normal  0.442672 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1675  hypothetical protein  36.78 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.418492  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5062  hypothetical protein  32.61 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00129853  hitchhiker  0.00597488 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2006  hypothetical protein  34.85 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0151829  normal  0.258425 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2315  chaperone-modulator protein CbpM  23.16 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01009  hypothetical protein  23.16 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1235  chaperone-modulator protein CbpM  23.16 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589416  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01002  modulator of CbpA co-chaperone  23.16 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2125  chaperone-modulator protein CbpM  23.16 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459962  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2596  chaperone-modulator protein CbpM  23.16 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1117  chaperone-modulator protein CbpM  23.16 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1111  chaperone-modulator protein CbpM  23.16 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2643  chaperone-modulator protein CbpM  23.16 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.813926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>