64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0262 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0262  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 110 aa  221  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.143032  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00590  hypothetical protein  47.14 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4436  regulatory protein MerR  45.83 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.465157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6430  hypothetical protein  35.35 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.418737 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3588  putative transcriptional regulator, MerR family  32.67 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0192393  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4025  hypothetical protein  39.02 
 
 		 106 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874833  normal  0.0674912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1572  hypothetical protein  39.19 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0815898 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2006  hypothetical protein  28.3 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0151829  normal  0.258425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  35.44 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  31.13 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  34.57 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  37.84 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  35.53 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  35.44 
 
 		 125 aa  48.1  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  32.35 
 
 		 126 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  30.86 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  36 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4804  transcriptional regulator, MerR family  29.03 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  31 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4230  putative transcriptional regulator, MerR family  34.18 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0585976  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2788  hypothetical protein  37.68 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 169 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0244  MerR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2405  hypothetical protein  26.47 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663215  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  32.91 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 143 aa  42.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  32.56 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1186  chaperone-modulator protein CbpM  30.99 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1070  chaperone-modulator protein CbpM  30.99 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1175  chaperone-modulator protein CbpM  30.99 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.585707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1221  chaperone-modulator protein CbpM  30.99 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.874491 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1206  chaperone-modulator protein CbpM  30.99 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.895073  normal  0.418844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3331  hypothetical protein  28.41 
 
 		 112 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426882  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  31.87 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5468  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1381  regulatory protein MerR  30.77 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2125  chaperone-modulator protein CbpM  28.41 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01009  hypothetical protein  28.41 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1235  chaperone-modulator protein CbpM  28.41 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2315  chaperone-modulator protein CbpM  28.41 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01002  modulator of CbpA co-chaperone  28.41 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2596  chaperone-modulator protein CbpM  28.41 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3861  chaperone-modulator protein CbpM  28.71 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.346166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1117  chaperone-modulator protein CbpM  28.41 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1111  chaperone-modulator protein CbpM  28.41 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0116  MerR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2643  chaperone-modulator protein CbpM  28.41 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.813926  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  27.78 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 205 aa  40.8  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0443  transcriptional regulator, MerR family  32.47 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0555  MerR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 125 aa  40  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>