15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6430 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6430  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  239  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.418737 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4436  regulatory protein MerR  43.97 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.465157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4025  hypothetical protein  57.47 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874833  normal  0.0674912 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3588  putative transcriptional regulator, MerR family  45.26 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0192393  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00590  hypothetical protein  44.05 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0262  MerR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.143032  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2788  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1572  hypothetical protein  39.77 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0815898 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1206  chaperone-modulator protein CbpM  32.94 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.895073  normal  0.418844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1221  chaperone-modulator protein CbpM  32.94 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.874491 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1175  chaperone-modulator protein CbpM  32.94 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.585707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1070  chaperone-modulator protein CbpM  32.94 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1186  chaperone-modulator protein CbpM  32.94 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0186  hypothetical protein  51.22 
 
 		 100 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4181  hypothetical protein  48.89 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00174567  normal  0.815603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>