24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0186 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0186  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2405  hypothetical protein  83 
 
 
100 aa  173  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663215  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3331  hypothetical protein  30.69 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426882  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3022  hypothetical protein  34.52 
 
 
114 aa  52  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4436  regulatory protein MerR  37.21 
 
 
109 aa  52  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.465157  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0568  hypothetical protein  40 
 
 
116 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0186842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1572  hypothetical protein  39.13 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0815898 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6321  hypothetical protein  38.27 
 
 
101 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1521  hypothetical protein  34.12 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1857  hypothetical protein  35.21 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000070649  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6287  hypothetical protein  36.71 
 
 
105 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02200  hypothetical protein  32.05 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1272  chaperone-modulator protein CbpM  42.86 
 
 
106 aa  44.3  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1224  hypothetical protein  42.86 
 
 
106 aa  44.3  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.654135  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  32.93 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3588  putative transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0192393  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4639  hypothetical protein  38.18 
 
 
101 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6430  hypothetical protein  51.22 
 
 
122 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.418737 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2788  hypothetical protein  37.65 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2099  hypothetical protein  31.33 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  30.38 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4025  hypothetical protein  30.59 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874833  normal  0.0674912 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4725  hypothetical protein  34.55 
 
 
101 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4847  hypothetical protein  34.55 
 
 
101 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.218293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>