43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3022 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3022  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  230  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3331  hypothetical protein  35.14 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426882  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02200  hypothetical protein  37.63 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3861  chaperone-modulator protein CbpM  35.42 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.346166  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1521  hypothetical protein  37.37 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4725  hypothetical protein  39.08 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4847  hypothetical protein  39.08 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.218293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4639  hypothetical protein  36.78 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0578  hypothetical protein  38.46 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1816  hypothetical protein  36.89 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4904  hypothetical protein  37.93 
 
 
101 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6287  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2190  hypothetical protein  31.13 
 
 
104 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6321  hypothetical protein  38.82 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1175  chaperone-modulator protein CbpM  36.46 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.585707  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1206  chaperone-modulator protein CbpM  36.46 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.895073  normal  0.418844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1221  chaperone-modulator protein CbpM  36.46 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.874491 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1070  chaperone-modulator protein CbpM  36.46 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1186  chaperone-modulator protein CbpM  36.46 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2099  hypothetical protein  29.79 
 
 
101 aa  57.4  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2218  hypothetical protein  30.19 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0722  hypothetical protein  35.71 
 
 
101 aa  57  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2125  chaperone-modulator protein CbpM  32.29 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459962  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2643  chaperone-modulator protein CbpM  32.29 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.813926  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2315  chaperone-modulator protein CbpM  32.29 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1235  chaperone-modulator protein CbpM  32.29 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589416  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01009  hypothetical protein  32.29 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2596  chaperone-modulator protein CbpM  32.29 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1117  chaperone-modulator protein CbpM  32.29 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1111  chaperone-modulator protein CbpM  32.29 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01002  modulator of CbpA co-chaperone  32.29 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1272  chaperone-modulator protein CbpM  31.58 
 
 
106 aa  54.3  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1224  hypothetical protein  31.58 
 
 
106 aa  54.3  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.654135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0186  hypothetical protein  34.52 
 
 
100 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1383  MerR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
104 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1125  hypothetical protein  31.65 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.335532 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2006  hypothetical protein  38.16 
 
 
98 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0151829  normal  0.258425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2405  hypothetical protein  35.37 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663215  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2344  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2131  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.75658  normal  0.434651 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0050  hypothetical protein  36.62 
 
 
109 aa  43.5  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2221  MerR family regulatory protein  36.51 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215829  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0491  hypothetical protein  31.68 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>