52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6287 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6287  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6321  hypothetical protein  72.92 
 
 		 101 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2344  MerR family transcriptional regulator  76.04 
 
 		 107 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1125  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.335532 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0722  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1521  hypothetical protein  47.31 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1383  MerR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1224  hypothetical protein  40.7 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.654135  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1272  chaperone-modulator protein CbpM  40.7 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02200  hypothetical protein  35.42 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2221  MerR family regulatory protein  39.47 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215829  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0578  hypothetical protein  37.97 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3861  chaperone-modulator protein CbpM  35.63 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.346166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2131  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.75658  normal  0.434651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2064  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2218  hypothetical protein  31.82 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1038  regulatory proteins, MerR family protein  42.67 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2190  hypothetical protein  31.4 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2596  chaperone-modulator protein CbpM  35.8 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2125  chaperone-modulator protein CbpM  35.8 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1235  chaperone-modulator protein CbpM  35.8 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589416  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01002  modulator of CbpA co-chaperone  35.8 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2315  chaperone-modulator protein CbpM  35.8 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1117  chaperone-modulator protein CbpM  35.8 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1111  chaperone-modulator protein CbpM  35.8 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01009  hypothetical protein  35.8 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2643  chaperone-modulator protein CbpM  35.8 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.813926  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0491  hypothetical protein  45.68 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1186  chaperone-modulator protein CbpM  37.18 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1070  chaperone-modulator protein CbpM  37.18 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1175  chaperone-modulator protein CbpM  37.18 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.585707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1221  chaperone-modulator protein CbpM  37.18 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.874491 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1206  chaperone-modulator protein CbpM  37.18 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.895073  normal  0.418844 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0050  hypothetical protein  36.14 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0553  hypothetical protein  52 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.944061 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0048  hypothetical protein  48.15 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4639  hypothetical protein  40.35 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3331  hypothetical protein  32.38 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426882  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2701  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0565675  hitchhiker  0.00000000716419 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1816  hypothetical protein  45.83 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4904  hypothetical protein  38.6 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4725  hypothetical protein  36.84 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4847  hypothetical protein  36.84 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218293 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0186  hypothetical protein  36.71 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0040  hypothetical protein  44.68 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.79338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0638  MerR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0617  MerR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2405  hypothetical protein  35.8 
 
 		 100 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663215  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2099  hypothetical protein  35.42 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0568  hypothetical protein  30.26 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0186842 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3237  hypothetical protein  30.11 
 
 		 104 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>