37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0568 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0568  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  233  8e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0186842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1660  DafA protein  69.47 
 
 		 103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.189701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1289  DafA protein  67.74 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.800937  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1857  hypothetical protein  61.96 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000070649  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0579  hypothetical protein  58.24 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0286  DafA protein  51.11 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  36.71 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0186  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4025  hypothetical protein  36.36 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874833  normal  0.0674912 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6321  hypothetical protein  31.37 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0425  putative transcriptional regulator, MerR family  33.8 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964854 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2405  hypothetical protein  38.75 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663215  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4436  regulatory protein MerR  32.93 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.465157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  32.47 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  30.38 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2006  hypothetical protein  32.22 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0151829  normal  0.258425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0133  hypothetical protein  31.43 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4230  putative transcriptional regulator, MerR family  31.65 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0585976  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1172  hypothetical protein  30.68 
 
 		 116 aa  43.5  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.91443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  28.95 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00590  hypothetical protein  30.23 
 
 		 103 aa  42.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  29.11 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  28.41 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  29.49 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  32.05 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  28.95 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1381  regulatory protein MerR  29.11 
 
 		 124 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3588  putative transcriptional regulator, MerR family  33.75 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0192393  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1224  hypothetical protein  32.89 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.654135  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1272  chaperone-modulator protein CbpM  32.89 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6287  hypothetical protein  30.26 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.816406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>