31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1857 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1857  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  204  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000070649  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0568  hypothetical protein  61.96 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0186842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1660  DafA protein  63.16 
 
 		 103 aa  120  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.189701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1289  DafA protein  54.44 
 
 		 105 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.800937  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0579  hypothetical protein  46.24 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0286  DafA protein  47.42 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2006  hypothetical protein  38.89 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0151829  normal  0.258425 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0425  putative transcriptional regulator, MerR family  28.95 
 
 		 80 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1572  hypothetical protein  30.43 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0815898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3588  putative transcriptional regulator, MerR family  32.94 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0192393  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0186  hypothetical protein  35.21 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4025  hypothetical protein  31.87 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874833  normal  0.0674912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  36.56 
 
 		 195 aa  43.9  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4436  regulatory protein MerR  37.5 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.465157  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  34.57 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  30.23 
 
 		 152 aa  42.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  33.75 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  33.75 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2405  hypothetical protein  37.68 
 
 		 100 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663215  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4230  putative transcriptional regulator, MerR family  32.63 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0585976  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4804  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5468  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0443  transcriptional regulator, MerR family  29.76 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0526  putative transcriptional regulator, MerR family  34.57 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>