14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4025 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4025  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  206  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874833  normal  0.0674912 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3588  putative transcriptional regulator, MerR family  61.54 
 
 		 106 aa  124  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0192393  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4436  regulatory protein MerR  54.81 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.465157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6430  hypothetical protein  57.47 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.418737 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2788  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1572  hypothetical protein  47.62 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0815898 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00590  hypothetical protein  42.31 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0262  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.143032  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0568  hypothetical protein  36.36 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0186842 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0579  hypothetical protein  34.62 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1857  hypothetical protein  31.87 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000070649  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0425  putative transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 		 80 aa  42.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964854 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4181  hypothetical protein  52.5 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00174567  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0186  hypothetical protein  30.59 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>