35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2218 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2218  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  209  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2190  hypothetical protein  98.08 
 
 
104 aa  205  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1272  chaperone-modulator protein CbpM  36.17 
 
 
106 aa  67  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1224  hypothetical protein  36.17 
 
 
106 aa  67  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.654135  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0722  hypothetical protein  32.63 
 
 
101 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6321  hypothetical protein  32.99 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1521  hypothetical protein  31.25 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1125  hypothetical protein  31 
 
 
100 aa  58.2  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.335532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3022  hypothetical protein  30.19 
 
 
114 aa  57.4  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6287  hypothetical protein  31.82 
 
 
105 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02200  hypothetical protein  34.04 
 
 
106 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2006  hypothetical protein  34.83 
 
 
98 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0151829  normal  0.258425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0578  hypothetical protein  32.18 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3331  hypothetical protein  32.43 
 
 
112 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426882  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1816  hypothetical protein  29.03 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1383  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2064  MerR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4847  hypothetical protein  29.27 
 
 
101 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.218293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4725  hypothetical protein  29.27 
 
 
101 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4904  hypothetical protein  29.27 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3861  chaperone-modulator protein CbpM  30.95 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.346166  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2344  MerR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4639  hypothetical protein  28.05 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2675  hypothetical protein  36.26 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246513  normal  0.442672 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2221  MerR family regulatory protein  28.17 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215829  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0133  hypothetical protein  37.74 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  36.51 
 
 
124 aa  41.6  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00590  hypothetical protein  32.76 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1206  chaperone-modulator protein CbpM  26.74 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.895073  normal  0.418844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1221  chaperone-modulator protein CbpM  26.74 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.874491 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1175  chaperone-modulator protein CbpM  26.74 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.585707  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1070  chaperone-modulator protein CbpM  26.74 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1186  chaperone-modulator protein CbpM  26.74 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  33.85 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  33.85 
 
 
124 aa  40.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>