37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4725 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4725  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  204  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4847  hypothetical protein  98.02 
 
 		 101 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4904  hypothetical protein  93.07 
 
 		 101 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4639  hypothetical protein  89.11 
 
 		 101 aa  187  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0578  hypothetical protein  60.61 
 
 		 101 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02200  hypothetical protein  47 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3861  chaperone-modulator protein CbpM  41.24 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.346166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1221  chaperone-modulator protein CbpM  43.88 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.874491 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1206  chaperone-modulator protein CbpM  43.88 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.895073  normal  0.418844 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1175  chaperone-modulator protein CbpM  43.88 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.585707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1070  chaperone-modulator protein CbpM  43.88 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1186  chaperone-modulator protein CbpM  43.88 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01009  hypothetical protein  39.18 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2315  chaperone-modulator protein CbpM  39.18 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2125  chaperone-modulator protein CbpM  39.18 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2596  chaperone-modulator protein CbpM  39.18 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1235  chaperone-modulator protein CbpM  39.18 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589416  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01002  modulator of CbpA co-chaperone  39.18 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1117  chaperone-modulator protein CbpM  39.18 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1111  chaperone-modulator protein CbpM  39.18 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2643  chaperone-modulator protein CbpM  39.18 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.813926  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2099  hypothetical protein  38.54 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1816  hypothetical protein  40.7 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3022  hypothetical protein  39.08 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1272  chaperone-modulator protein CbpM  35.53 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1224  hypothetical protein  35.53 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.654135  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0722  hypothetical protein  37.5 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3331  hypothetical protein  32.29 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426882  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1125  hypothetical protein  35 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.335532 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1383  MerR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6321  hypothetical protein  31.4 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2218  hypothetical protein  29.27 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6287  hypothetical protein  36.84 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2190  hypothetical protein  29.27 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1521  hypothetical protein  29.21 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2405  hypothetical protein  33.82 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663215  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0186  hypothetical protein  34.55 
 
 		 100 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>