38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1125 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1125  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  200  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.335532 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0722  hypothetical protein  86.87 
 
 		 101 aa  178  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6287  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6321  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2344  MerR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1272  chaperone-modulator protein CbpM  42.39 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1224  hypothetical protein  42.39 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.654135  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1521  hypothetical protein  42.39 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1383  MerR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0578  hypothetical protein  43.75 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02200  hypothetical protein  41.25 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2221  MerR family regulatory protein  37.66 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215829  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2131  MerR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.75658  normal  0.434651 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2218  hypothetical protein  31 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2190  hypothetical protein  31 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4904  hypothetical protein  36.25 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3331  hypothetical protein  33.02 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426882  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4639  hypothetical protein  36.25 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1038  regulatory proteins, MerR family protein  40.28 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4725  hypothetical protein  35 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4847  hypothetical protein  35 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218293 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0491  hypothetical protein  41.38 
 
 		 118 aa  52  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2064  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3022  hypothetical protein  31.65 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1816  hypothetical protein  34.78 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2701  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0565675  hitchhiker  0.00000000716419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3237  hypothetical protein  34.18 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0050  hypothetical protein  28.4 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2983  MerR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1427  MerR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3861  chaperone-modulator protein CbpM  34.18 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.346166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1206  chaperone-modulator protein CbpM  32.91 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.895073  normal  0.418844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1221  chaperone-modulator protein CbpM  32.91 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.874491 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1175  chaperone-modulator protein CbpM  32.91 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.585707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1070  chaperone-modulator protein CbpM  32.91 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1186  chaperone-modulator protein CbpM  32.91 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2099  hypothetical protein  28.21 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0048  hypothetical protein  42.22 
 
 		 107 aa  40  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.467977 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>