52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1038 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1038  regulatory proteins, MerR family protein  100 
 
 		 102 aa  202  9e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1521  hypothetical protein  45.83 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6321  hypothetical protein  42.71 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1125  hypothetical protein  41.94 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.335532 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6287  hypothetical protein  45.26 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0722  hypothetical protein  44.44 
 
 		 101 aa  73.6  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1272  chaperone-modulator protein CbpM  35.29 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1224  hypothetical protein  35.29 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.654135  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2221  MerR family regulatory protein  47.37 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215829  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3331  hypothetical protein  36.96 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426882  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3237  hypothetical protein  44.87 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1383  MerR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2344  MerR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0491  hypothetical protein  44.33 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2064  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2131  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.75658  normal  0.434651 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3022  hypothetical protein  35.56 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2218  hypothetical protein  31 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2190  hypothetical protein  30 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0050  hypothetical protein  41.46 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1427  MerR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2983  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0638  MerR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0617  MerR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1221  chaperone-modulator protein CbpM  37.35 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.874491 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1206  chaperone-modulator protein CbpM  37.35 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.895073  normal  0.418844 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1175  chaperone-modulator protein CbpM  37.35 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.585707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0262  MerR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.143032  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1070  chaperone-modulator protein CbpM  37.35 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1186  chaperone-modulator protein CbpM  37.35 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0578  hypothetical protein  30.59 
 
 		 101 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02200  hypothetical protein  32.47 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0425  putative transcriptional regulator, MerR family  36.49 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964854 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1381  regulatory protein MerR  34.85 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1430  MerR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  42.31 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4639  hypothetical protein  30.56 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  38.46 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  39.66 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 124 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 124 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0048  hypothetical protein  36.71 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4904  hypothetical protein  31.88 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  38.89 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4847  hypothetical protein  32.39 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218293 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1816  hypothetical protein  27.96 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2701  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 98 aa  41.2  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0565675  hitchhiker  0.00000000716419 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0040  hypothetical protein  37.97 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.79338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0443  transcriptional regulator, MerR family  26.97 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4725  hypothetical protein  29.47 
 
 		 101 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>