20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3237 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3237  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  207  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1521  hypothetical protein  36.26 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1427  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1038  regulatory proteins, MerR family protein  43.86 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0050  hypothetical protein  36.14 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1430  MerR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2983  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0638  MerR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0617  MerR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2221  MerR family regulatory protein  35.14 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215829  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6321  hypothetical protein  36.9 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0578  hypothetical protein  33.73 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1125  hypothetical protein  34.18 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.335532 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0722  hypothetical protein  34.62 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2064  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1383  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02200  hypothetical protein  35.42 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0048  hypothetical protein  33.73 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0040  hypothetical protein  34.94 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.79338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6287  hypothetical protein  30.11 
 
 		 105 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.816406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>