37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1521 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1521  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  241  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2064  MerR family transcriptional regulator  52.88 
 
 
106 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6287  hypothetical protein  47.31 
 
 
105 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1125  hypothetical protein  42.39 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.335532 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2221  MerR family regulatory protein  47.3 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215829  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0722  hypothetical protein  41.3 
 
 
101 aa  72  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6321  hypothetical protein  41.67 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0491  hypothetical protein  52.38 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1272  chaperone-modulator protein CbpM  38.14 
 
 
106 aa  70.1  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1224  hypothetical protein  38.14 
 
 
106 aa  70.1  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.654135  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3022  hypothetical protein  37.37 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3237  hypothetical protein  36.26 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1383  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
104 aa  62  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3331  hypothetical protein  33.96 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426882  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1038  regulatory proteins, MerR family protein  42.86 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2218  hypothetical protein  31.25 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2190  hypothetical protein  31.25 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0578  hypothetical protein  34.57 
 
 
101 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2131  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.75658  normal  0.434651 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2344  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0050  hypothetical protein  30.86 
 
 
109 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0638  MerR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
113 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0617  MerR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
113 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02200  hypothetical protein  34.57 
 
 
106 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1816  hypothetical protein  31.58 
 
 
105 aa  51.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2405  hypothetical protein  36.9 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663215  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0186  hypothetical protein  34.12 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4639  hypothetical protein  30.86 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1172  hypothetical protein  30.21 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.91443  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1430  MerR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
102 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1427  MerR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2006  hypothetical protein  47.5 
 
 
98 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0151829  normal  0.258425 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2701  transcriptional regulator, MerR family  33.67 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0565675  hitchhiker  0.00000000716419 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4725  hypothetical protein  29.21 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352238 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00590  hypothetical protein  39.68 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  41.07 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4904  hypothetical protein  30.86 
 
 
101 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>