50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0578 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0578  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  199  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4639  hypothetical protein  63.64 
 
 		 101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4904  hypothetical protein  62.63 
 
 		 101 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4847  hypothetical protein  60.61 
 
 		 101 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4725  hypothetical protein  60.61 
 
 		 101 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352238 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02200  hypothetical protein  46.46 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1111  chaperone-modulator protein CbpM  39.18 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01009  hypothetical protein  39.18 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1235  chaperone-modulator protein CbpM  39.18 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2315  chaperone-modulator protein CbpM  39.18 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2125  chaperone-modulator protein CbpM  39.18 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2596  chaperone-modulator protein CbpM  39.18 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1117  chaperone-modulator protein CbpM  39.18 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01002  modulator of CbpA co-chaperone  39.18 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2643  chaperone-modulator protein CbpM  39.18 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.813926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3861  chaperone-modulator protein CbpM  39.18 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.346166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1816  hypothetical protein  42.7 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1186  chaperone-modulator protein CbpM  40 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1070  chaperone-modulator protein CbpM  40 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1175  chaperone-modulator protein CbpM  40 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.585707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1221  chaperone-modulator protein CbpM  40 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.874491 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1206  chaperone-modulator protein CbpM  40 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.895073  normal  0.418844 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0722  hypothetical protein  45 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1272  chaperone-modulator protein CbpM  41.11 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1224  hypothetical protein  41.11 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.654135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2099  hypothetical protein  34.74 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1125  hypothetical protein  43.75 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.335532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3022  hypothetical protein  38.46 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6321  hypothetical protein  36.05 
 
 		 101 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6287  hypothetical protein  37.97 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3331  hypothetical protein  34.38 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426882  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1521  hypothetical protein  34.57 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2701  transcriptional regulator, MerR family  33.77 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0565675  hitchhiker  0.00000000716419 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1383  MerR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2218  hypothetical protein  32.18 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2190  hypothetical protein  32.18 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1427  MerR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1572  hypothetical protein  34.83 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0815898 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3237  hypothetical protein  33.73 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2221  MerR family regulatory protein  35.59 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215829  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2983  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0491  hypothetical protein  38.75 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0050  hypothetical protein  36.36 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0048  hypothetical protein  39.22 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2344  MerR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0638  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 113 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0040  hypothetical protein  41.18 
 
 		 107 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.79338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0617  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 113 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2064  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0133  hypothetical protein  30.68 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>